4 个月前

BCI:通过金字塔Pix2pix生成乳腺癌免疫组化图像

BCI:通过金字塔Pix2pix生成乳腺癌免疫组化图像

摘要

评估人类表皮生长因子受体2(HER2)的表达对于制定乳腺癌的精准治疗方案至关重要。目前,常规的HER2评估方法是通过免疫组化技术(IHC)进行,但该技术成本较高。因此,我们首次提出了一种乳腺癌免疫组化(BCI)基准,尝试直接将IHC数据与配对的苏木精和伊红(HE)染色图像合成。该数据集包含4870个注册图像对,涵盖了多种HER2表达水平。基于BCI,作为次要贡献,我们进一步构建了一种金字塔pix2pix图像生成方法,该方法在HE到IHC的转换结果上优于其他当前流行的算法。大量实验表明,BCI为现有的图像翻译研究带来了新的挑战。此外,BCI还为未来基于合成IHC图像的HER2表达评估病理学研究打开了大门。BCI数据集可从https://bupt-ai-cz.github.io/BCI 下载。

代码仓库

bupt-ai-cz/BCI
官方
pytorch
GitHub 中提及

基准测试

基准方法指标
image-to-image-translation-on-bcipyramidpix2pix
Average PSNR: 21.160
SSIM: 0.477
image-to-image-translation-on-bcipix2pix
Average PSNR: 19.328
SSIM: 0.440
image-to-image-translation-on-bcipix2pixHD
Average PSNR: 19.634
SSIM: 0.471
image-to-image-translation-on-bcicycleGAN
Average PSNR: 16.203
SSIM: 0.373
image-to-image-translation-on-flirBCI
PSNR: 11.14
SSIM: 0.21
image-to-image-translation-on-llvipcycleGAN
PSNR: 11.22
SSIM: 0.214
image-to-image-translation-on-llvippix2pixHD
PSNR: 11.156
SSIM: 0.228
image-to-image-translation-on-llvippyramidpix2pix
PSNR: 12.191
SSIM: 0.278

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