
摘要
评估人类表皮生长因子受体2(HER2)的表达对于制定乳腺癌的精准治疗方案至关重要。目前,常规的HER2评估方法是通过免疫组化技术(IHC)进行,但该技术成本较高。因此,我们首次提出了一种乳腺癌免疫组化(BCI)基准,尝试直接将IHC数据与配对的苏木精和伊红(HE)染色图像合成。该数据集包含4870个注册图像对,涵盖了多种HER2表达水平。基于BCI,作为次要贡献,我们进一步构建了一种金字塔pix2pix图像生成方法,该方法在HE到IHC的转换结果上优于其他当前流行的算法。大量实验表明,BCI为现有的图像翻译研究带来了新的挑战。此外,BCI还为未来基于合成IHC图像的HER2表达评估病理学研究打开了大门。BCI数据集可从https://bupt-ai-cz.github.io/BCI 下载。
代码仓库
bupt-ai-cz/BCI
官方
pytorch
GitHub 中提及
基准测试
| 基准 | 方法 | 指标 |
|---|---|---|
| image-to-image-translation-on-bci | pyramidpix2pix | Average PSNR: 21.160 SSIM: 0.477 |
| image-to-image-translation-on-bci | pix2pix | Average PSNR: 19.328 SSIM: 0.440 |
| image-to-image-translation-on-bci | pix2pixHD | Average PSNR: 19.634 SSIM: 0.471 |
| image-to-image-translation-on-bci | cycleGAN | Average PSNR: 16.203 SSIM: 0.373 |
| image-to-image-translation-on-flir | BCI | PSNR: 11.14 SSIM: 0.21 |
| image-to-image-translation-on-llvip | cycleGAN | PSNR: 11.22 SSIM: 0.214 |
| image-to-image-translation-on-llvip | pix2pixHD | PSNR: 11.156 SSIM: 0.228 |
| image-to-image-translation-on-llvip | pyramidpix2pix | PSNR: 12.191 SSIM: 0.278 |