4 个月前

MedFuse:结合临床时间序列数据和胸部X光图像的多模态融合方法

MedFuse:结合临床时间序列数据和胸部X光图像的多模态融合方法

摘要

多模态融合方法旨在整合来自不同数据源的信息。与音频-视觉应用中的自然数据集不同,这些数据集中的样本由“配对”的模态组成,医疗健康领域的数据通常是非同步收集的。因此,对于临床任务而言,要求每个样本都具备所有模态信息是不现实的,并且在训练过程中会显著限制数据集的规模。本文提出了一种概念简单但前景广阔的基于LSTM的融合模块MedFuse,该模块可以处理单模态和多模态输入。我们评估了该融合方法,并在MIMIC-IV数据集中使用临床时间序列数据以及MIMIC-CXR中对应的胸部X光图像,为院内死亡率预测和表型分类引入了新的基准结果。与更为复杂的多模态融合策略相比,MedFuse在完全配对的测试集上提供了显著的性能提升,并且在部分配对测试集(包含缺失胸部X光图像的样本)中仍保持稳健。为了提高可重复性和便于未来评估竞争模型,我们发布了代码。

代码仓库

nyuad-cai/medfuse
官方
pytorch
GitHub 中提及

基准测试

基准方法指标
phenotype-classification-on-mimic-cxr-mimicMedFuse (optimal)
AUROC: 0.77

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