4 个月前

BeSt-LeS:使用深度监督的脑卒中病灶分割基准测试

BeSt-LeS:使用深度监督的脑卒中病灶分割基准测试

摘要

脑卒中已成为全球健康的重要负担,因此我们需要采取治疗措施和预防策略来应对这一挑战。为此,临床医生的首要任务是立即识别脑卒中并进行风险分层。为了辅助专家临床医生,自动分割模型至关重要。在本研究中,我们使用公开可用的数据集ATLAS v2.0对多种端到端监督的U-Net风格模型进行了基准测试。具体而言,我们在2D和3D脑图像上对这些模型进行了基准测试,并使用标准指标对其性能进行了评估。我们分别在基于2D变压器(transformer)的模型上获得了最高的Dice分数0.583,在3D残差U-Net上获得了0.504的Dice分数。此外,我们对3D模型进行了Wilcoxon检验,以探讨预测卒中体积与实际卒中体积之间的关系。为了确保可重复性,代码和模型权重已公开发布:https://github.com/prantik-pdeb/BeSt-LeS。

代码仓库

prantik-pdeb/best-les
官方
pytorch
GitHub 中提及

基准测试

基准方法指标
acute-stroke-lesion-segmentation-on-atlas-v22D U-Net Transformer
Dice Score: 0.583
acute-stroke-lesion-segmentation-on-atlas-v23D Residual U-Net
Dice Score: 0.504

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