3 个月前

ParaTransCNN:用于医学图像分割的并行化TransCNN编码器

ParaTransCNN:用于医学图像分割的并行化TransCNN编码器

摘要

基于卷积神经网络(CNN)的方法因其卓越的性能,在医学图像分割领域日益受到青睐。然而,这类方法在捕捉长距离依赖关系方面存在局限,而长距离依赖对于准确建模全局上下文关联至关重要。得益于其通过扩展感受野来建模长距离依赖的能力,基于Transformer的方法逐渐崭露头角。受此启发,本文提出一种先进的二维特征提取方法,通过融合卷积神经网络与Transformer架构的优势,实现更精准的特征表达。具体而言,我们设计了一种并行编码器结构:其中一条分支采用ResNet提取图像的局部特征,另一条分支则利用Transformer捕捉全局上下文信息。此外,我们在Transformer中引入金字塔结构,以在不同分辨率下提取全局信息,尤其适用于高精度预测任务。为在解码阶段高效融合并行编码器中提取的多源信息,我们引入通道注意力模块,对编码器输出的特征进行加权融合,并通过跳跃连接与瓶颈结构实现特征的逐层传递。我们在主动脉血管树、心脏以及多器官等多个医学图像数据集上进行了大量数值实验。与当前最先进的医学图像分割方法相比,所提方法在分割精度上表现更优,尤其在小器官分割任务中展现出显著优势。相关代码已公开发布于GitHub:https://github.com/HongkunSun/ParaTransCNN。

代码仓库

hongkunsun/paratranscnn
官方
pytorch
GitHub 中提及

基准测试

基准方法指标
medical-image-segmentation-on-synapse-multiParaTransCNN
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