3 个月前

Trans2Unet:用于细胞核语义分割的神经融合方法

Trans2Unet:用于细胞核语义分割的神经融合方法

摘要

尽管核分割在组织病理学图像分析中具有基础性作用,但仍是一项极具挑战性的任务。该任务的主要难点在于存在核重叠区域,这使得独立核的分离变得更加复杂。本文提出了一种新型双分支网络架构,通过融合Unet与TransUnet网络结构,用于核分割任务。所提出的架构命名为Trans2Unet:首先,输入图像被送入Unet分支,该分支的最后一个卷积层被移除,从而使得网络能够整合输入图像中不同空间区域的特征,并更精确地定位感兴趣区域。与此同时,输入图像也被送入第二个分支——即TransUnet分支,在该分支中,图像被划分为多个图像块(patches)。借助视觉Transformer(Vision Transformer, ViT)结构,TransUnet可作为医学图像分割任务中的强大编码器,通过恢复局部空间信息来增强图像细节。为进一步提升Trans2Unet的效率与性能,本文提出引入一种计算高效的变体模块——“瀑布”空洞空间池化带跳跃连接(Waterfall Atrous Spatial Pooling with Skip Connection, WASP-KC)模块,该模块的设计灵感来源于“瀑布”空洞空间池化(WASP)模块。在2018年Data Science Bowl基准数据集上的实验结果表明,所提出的Trans2Unet架构在分割性能上优于以往的多种模型,充分验证了其有效性与先进性。

基准测试

基准方法指标
medical-image-segmentation-on-2018-dataTrans2Unet
Dice: 0.9225
mIoU: 0.8614
medical-image-segmentation-on-glasTrans2Unet
Dice: 89.84
F1: 89.84
IoU: 82.54

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