3 个月前

扩展医学十项全能数据集:基于计算机断层扫描图像的结肠及结直肠癌分割

扩展医学十项全能数据集:基于计算机断层扫描图像的结肠及结直肠癌分割

摘要

结直肠癌是西半球发病率第三高的癌症。通过计算机断层扫描(CT)对结直肠及其癌变组织进行精准分割,是当前医学领域亟待解决的重要问题。若能实现这一目标,将有助于在疾病早期阶段发现结直肠癌,辅助放射科医生更高效地定位病灶,显著提升诊断效率。然而,目前医学图像处理领域的科研论文大多基于封闭、非公开的数据集。为此,本文对Medical Decathlon数据集进行了扩展,新增了结直肠区域的标注信息,旨在提升分割算法的整体性能。所有标注均由经验丰富的放射科医生进行验证,并根据质量水平划分为不同子集,最终公开发布于公共平台。基于上述数据,我们采用UNet架构的神经网络模型,结合五折交叉验证方法进行训练,最终获得的Dice系数为 $0.6988 \pm 0.3$。所发布的标注数据将有助于提升结直肠癌的检测精度,并简化放射科医生在影像报告撰写中的工作流程。

代码仓库

blacky-i/MDE_colon_segmentation
官方
GitHub 中提及

基准测试

基准方法指标
medical-image-segmentation-on-extended-task10nnUNet
Average Dice: 0.6988

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