3 个月前

患者轨迹预测:融合临床笔记与Transformer模型

患者轨迹预测:融合临床笔记与Transformer模型

摘要

从电子健康记录(EHRs)中预测疾病发展轨迹是一项复杂任务,主要面临数据非平稳性、医学编码粒度高以及多模态数据融合等重大挑战。EHRs既包含结构化数据(如诊断编码),也包含非结构化数据(如临床病历文本),而后者往往蕴含着被忽视的关键信息。当前主流模型主要依赖结构化数据,难以全面捕捉患者的完整医疗背景,导致重要信息的丢失。为解决这一问题,我们提出一种将非结构化临床文本整合至基于Transformer的深度学习模型中的方法,用于序列化疾病预测。该方法通过融合临床笔记,丰富了患者医疗史的表征能力,从而显著提升诊断预测的准确性。在MIMIC-IV数据集上的实验结果表明,所提出的方法在性能上优于仅依赖结构化数据的传统模型。

代码仓库

MostHumble/PatientTrajectoryForecasting
官方
pytorch
GitHub 中提及

基准测试

基准方法指标
natural-language-inference-on-mednliClinicalMosaic
Accuracy: 86.59
Params (M): 137

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