3 个月前

深度学习与传统机器学习在生物医学文献知识提取中的融合

深度学习与传统机器学习在生物医学文献知识提取中的融合

摘要

在本文中,我们介绍了参与2019年BioNLP-OST会议“细菌生境(Bacteria Biotope, BB)”任务的工作。我们的系统采用微调的语言表示模型,并结合基于词嵌入(word embedding)与词汇特征的机器学习方法,用于实体识别、实体归一化及关系抽取。该系统取得了当前最优的性能,在全部六个子任务中的五个中位列前两名。

基准测试

基准方法指标
medical-concept-normalization-on-bb-norm-1BLAIR GMU
accuracy: 0.211
wang: 0.615
medical-concept-normalization-on-bb-norm-2BLAIR GMU
accuracy: 0.313
wang: 0.646

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